Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Nop58Q6DFW4 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms