Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms