Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ctdnep1Q3TP92 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ctdnep1Q3TP92 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ctdnep1Q3TP92 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ctdnep1Q3TP92 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ctdnep1Q3TP92 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Ctdnep1Q3TP92 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ctdnep1Q3TP92 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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Ctdnep1Q3TP92 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms