Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rpusd3Q14AI6 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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