Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
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Rpusd2Q149F1 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Rpusd2Q149F1 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
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