Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Atp2b3Q0VF55 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms