Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms