Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd8P23463 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms