Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Ccl20O89093 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccl20O89093 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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