Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Spocd1B1ASB6 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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