Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms