Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms