Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Col5a3Q9JLI2 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms