Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
OtofQ9ESF1 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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