Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Ccdc18Q640L5 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Ccdc18Q640L5 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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Ccdc18Q640L5 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Ccdc18Q640L5 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ccdc18Q640L5 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ccdc18Q640L5 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ccdc18Q640L5 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Ccdc18Q640L5 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccdc18Q640L5 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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