Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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