Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms