Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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