Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
VdrP48281 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
VdrP48281 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
VdrP48281 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
VdrP48281 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
VdrP48281 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms