Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Col5a3Q9JLI2 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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