Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Cldn22Q9D7U6 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms