Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
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