Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp1Q8BJQ2 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp1Q8BJQ2 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp1Q8BJQ2 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp1Q8BJQ2 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp1Q8BJQ2 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms