Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ubash3bQ8BGG7 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms