Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms