Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ggta1P23336 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms