Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-Eb1P04230 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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