Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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Ccl20O89093 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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Ccl20O89093 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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Ccl20O89093 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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Ccl20O89093 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccl20O89093 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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