Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms