Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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