Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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