Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Ccdc47Q9D024 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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