Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PtprtQ99M80 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprtQ99M80 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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