Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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Ercc8Q8CFD5 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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Ercc8Q8CFD5 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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Ercc8Q8CFD5 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms