Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Hadha-205ENSMUST00000156859 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Rab3gap1-201ENSMUST00000037649 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Hacl1-202ENSMUST00000127204 1699 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm37957-201ENSMUST00000192182 2303 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Arpp21-221ENSMUST00000162065 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Stau2-207ENSMUST00000131257 3616 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Etfbkmt-203ENSMUST00000111548 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Olfr641-202ENSMUST00000213214 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 C230053D17Rik-201ENSMUST00000214451 2246 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Lingo2-204ENSMUST00000108124 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Acox3-202ENSMUST00000068947 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Igkv3-3-201ENSMUST00000103402 359 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Igkv3-1-201ENSMUST00000103404 359 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Trav9-1-201ENSMUST00000103581 398 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm7331-201ENSMUST00000118642 387 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Uba52-208ENSMUST00000165126 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Trav9d-1-201ENSMUST00000178426 337 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm25196-201ENSMUST00000180171 110 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm27483-201ENSMUST00000184983 71 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm29585-202ENSMUST00000187855 425 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Igkv3-6-201ENSMUST00000196007 342 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm44987-201ENSMUST00000206578 750 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm31126-201ENSMUST00000222366 533 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Pgm2-202ENSMUST00000102783 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Mcf2l-201ENSMUST00000095456 3926 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Phactr4-201ENSMUST00000084170 4483 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Map4k4-213ENSMUST00000193682 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm44154-201ENSMUST00000204559 2724 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Xndc1-202ENSMUST00000106950 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Slc26a8-201ENSMUST00000114764 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Myo1g-201ENSMUST00000003459 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Extl2-201ENSMUST00000029575 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Taf12-201ENSMUST00000030731 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Adgrl2-204ENSMUST00000195988 4541 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Cd209c-201ENSMUST00000044060 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Gcnt1-203ENSMUST00000174236 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Trim35Q8C006 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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