Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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