Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26521-201ENSMUST00000181576 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 n-R5s165-201ENSMUST00000104074 100 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14967-201ENSMUST00000153483 335 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpc-205ENSMUST00000227242 2617 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Mpp1-203ENSMUST00000114092 1378 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc21a-201ENSMUST00000035100 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Exoc1-203ENSMUST00000113493 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Crtam-201ENSMUST00000034519 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Adam9-201ENSMUST00000084032 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Cald1-202ENSMUST00000079391 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpc-209ENSMUST00000228198 2498 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Def8-205ENSMUST00000108832 3242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Def8-201ENSMUST00000001522 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Cntn4-205ENSMUST00000113261 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Itgb2l-202ENSMUST00000113773 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gtpbp6Q3U6U5 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ephx2-203ENSMUST00000225309 2032 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Apex2-201ENSMUST00000026303 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Immt-201ENSMUST00000064062 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc16-201ENSMUST00000022377 4028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Adra2b-201ENSMUST00000071902 3936 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gtpbp6Q3U6U5 Dync2h1-202ENSMUST00000139115 2892 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms