Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Q3U6N9 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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