Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Ctdnep1Q3TP92 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Ctdnep1Q3TP92 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ctdnep1Q3TP92 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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