Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms