Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms