Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd10P28359 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Hoxd10P28359 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd10P28359 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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