Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Usp35M0QWN7 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms