Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms