Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3238W4VSP7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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