Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r25W4VSP2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms