Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vstm4T1NXB5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vstm4T1NXB5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms