Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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