Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mbd3Q9Z2D8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms