Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccne2Q9Z238 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccne2Q9Z238 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms